Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms