Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp1Q00915 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp1Q00915 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms