Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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