Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Otx2P80206 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms