Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CdaP56389 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CdaP56389 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms