Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rad23bP54728 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rad23bP54728 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rad23bP54728 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rad23bP54728 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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