Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgd1P52734 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgd1P52734 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms