Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ube2e3P52483 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms