Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ClgnP52194 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms