Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VdrP48281 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VdrP48281 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
VdrP48281 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VdrP48281 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
VdrP48281 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms