Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TgfaP48030 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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