Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tnfsf9P41274 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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