Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprkP35822 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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