Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RxraP28700 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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RxraP28700 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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