Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PdgfraP26618 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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