Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gdf1P20863 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gdf1P20863 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms