Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms