Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18526 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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P18526 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P18526 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P18526 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P18526 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P18526 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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P18526 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18526 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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P18526 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P18526 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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