Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CtsdP18242 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CtsdP18242 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms