Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms