Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms