Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spp1P10923 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms