Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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H2-Eb1P04230 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Eb1P04230 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms