Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab33bO35963 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms