Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Slc1a6O35544 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Slc1a6O35544 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Slc1a6O35544 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc1a6O35544 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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