Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MttpO08601 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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MttpO08601 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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MttpO08601 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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MttpO08601 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MttpO08601 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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