Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm8356J3QPD3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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