Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms