Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21976J3QNN2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21976J3QNN2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21976J3QNN2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21976J3QNN2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21976J3QNN2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21976J3QNN2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm21976J3QNN2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm21976J3QNN2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm21976J3QNN2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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