Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20834J3QM72 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms