Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms