Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm20828J3KMI7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20828J3KMI7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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