Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Taf4bG5E8Z2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms