Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vmn1r58G3X9U3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms