Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Igkv1-99F6XWB2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Igkv1-99F6XWB2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms