Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Susd1E9Q3H4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Susd1E9Q3H4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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