Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rdh8D3Z6W3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms