Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms