Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf217D3YYI7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms