Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmf1B9EKI3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms