Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Phf11cB4XVP9 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Phf11cB4XVP9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Phf11cB4XVP9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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