Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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