Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Spocd1B1ASB6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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