Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf2A3KGV1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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