Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SetxA2AKX3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SetxA2AKX3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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