Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prdm16A2A935 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.8 ms