Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tsc22d3Q9Z2S7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms