Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Vamp5Q9Z2P8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Vamp5Q9Z2P8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms