Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ubl3Q9Z2M6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms