Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ilf3Q9Z1X4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms